Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssc5dQ8BV57 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssc5dQ8BV57 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssc5dQ8BV57 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssc5dQ8BV57 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssc5dQ8BV57 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms