Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubash3bQ8BGG7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms