Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Htatsf1Q8BGC0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htatsf1Q8BGC0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Htatsf1Q8BGC0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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