Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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