Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Avl9Q80U56 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Avl9Q80U56 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Avl9Q80U56 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Avl9Q80U56 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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