Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms