Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmeff1Q6PFE7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmeff1Q6PFE7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmeff1Q6PFE7 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmeff1Q6PFE7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmeff1Q6PFE7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmeff1Q6PFE7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmeff1Q6PFE7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmeff1Q6PFE7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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