Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms