Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Hes3Q61657 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Hes3Q61657 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Hes3Q61657 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Hes3Q61657 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Hes3Q61657 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Hes3Q61657 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Hes3Q61657 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Hes3Q61657 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Hes3Q61657 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Hes3Q61657 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hes3Q61657 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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