Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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