Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ripk1Q60855 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ripk1Q60855 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ripk1Q60855 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ripk1Q60855 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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