Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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