Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms