Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms