Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pydc3Q3V3Q4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pydc3Q3V3Q4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pydc3Q3V3Q4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pydc3Q3V3Q4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pydc3Q3V3Q4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pydc3Q3V3Q4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms