Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm29609Q3UU56 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm29609Q3UU56 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm29609Q3UU56 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm29609Q3UU56 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm29609Q3UU56 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm29609Q3UU56 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm29609Q3UU56 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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