Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Acsf3Q3URE1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Acsf3Q3URE1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Acsf3Q3URE1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms