Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp19Q3UJD6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms