Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms