Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms