Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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