Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms