Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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