Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Usp39Q3TIX9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms