Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms