Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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