Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms