Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms