Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AmbpQ07456 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms