Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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