Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gdf9Q07105 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms