Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Siah2Q06986 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Siah2Q06986 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Siah2Q06986 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Siah2Q06986 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Siah2Q06986 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Siah2Q06986 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Siah2Q06986 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Siah2Q06986 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms