Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcr5Q04683 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms