Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms