Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GscQ02591 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GscQ02591 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GscQ02591 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GscQ02591 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GscQ02591 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GscQ02591 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GscQ02591 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GscQ02591 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
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GscQ02591 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms