Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms