Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grin2cQ01098 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms