Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms