Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms