Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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