Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vsnl1P62761 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vsnl1P62761 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms