Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf13P61216 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms