Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PctpP53808 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms