Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa6P50704 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms