Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TspoP50637 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms