Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms