Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms