Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rab11bP46638 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rab11bP46638 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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