Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtbP41155 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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LtbP41155 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtbP41155 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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