Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lig1P37913 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lig1P37913 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms